La chiesa di Santa Maria fu costruita nel XV° secolo come una struttura a navata unica, al posto di una vecchia cappella dedicata alla Santa Croce. La chiesa di Santa Maria venne realizzata grazie alle donazioni ottenute dalle navi in arrivo e a quelle dell'aristocrazia di Hvar. Dopo la costruzione divenne la chiesa dei marinai, come ci confermano le numerose iscrizioni dei nomi dei comandanti navali veneziani trovati all'interno della chiesa e attorno ad essa. Nel periodo compreso tra 1465 e 1471 nel timpano del portale centrale venne innalzata la statua della Vergine col Bambino, opera di Nicola di Firenze. Nel 1536 fu costruita la navata settentrionale della chiesa con la cappella rinascimentale della Santa Croce. All'interno della chiesa si trovano gli altari del XVI° secolo, il coro col crocifisso rinascimentale, un'opera veneziana risalente al XVI° secolo, e la tomba del famoso poeta Annibale Lucio. Nel refettorio campeggia il dipinto "L'Ultima Cena", opera di Matteo Ponzona. Nel monastero trovano posto la biblioteca, una collezione del museo e un cipresso centenerio.