Crkva sv. Marije sagrađena je u 15. st. kao jednobrodna gotička građevina, na mjestu starije kapelice sv. Križa. Crkva sv. Marije sagrađena je donacijama zapovjednika brodova koji su dolazili u Hvar te donacijama hvarskih plemića. Nakon gradnje, postala je crkva mornara što se može zaključiti iz niza natpisa mletačkih pomorskih zapovjednika unutar crkve i oko nje. U luneti glavnog portala postavljen je 1465. - 1471. godine Gospin kip s djetetom, rad Nikole Firentinca. Godine 1536. izgrađen je sjeverni brod crkve s renesansnom kapelom sv. Križa. U unutrašnjosti crkve su oltari iz 16. st., kor s renesansnim raspelom, mletački rad iz 16. st., te grob hvarskog pjesnika Hanibala Lucića. U refektoriju je slika “Posljednja večera”, rad Mattea Ponzonia. U sklopu samostana je biblioteka i muzejska zbirka te stogodišnji čempres.